Jaringan ulama Timur Tengah dan Kepulauan Nusantara abad XVII dan XVIII : melacak akar-akar pembaruan pemikiran Islam di Indonesia
After the prophet : kisah lengkap muasal perpecahan Sunni-Syiah
Wajah dunia Islam dari dinasti Bani Umayyah hingga imprialisme modern
Kebijaksanaan politik Nabi saw.
Islam dan konflik politik era Orde Baru
Islam and politics under the new order government in Indonesia 1966-1990
Politik dan kekuasaan dalam sejarah para khalifah
Islam dan politik : teori belah bambu masa demokrasi terpimpin (1959-1965)
Sirah Nabawiyah
Menguak sejarah mencari 'ibrah : risalah sejarah sosial-intelektual muslim klasik