Filsafat sejarah islam syi'ah : awal kemunculan dan konstruksi sejarah syi'ah sebagai kelompok dan ajaran
I`lam As-Sajid bi ahkami al-masajid
Kesultanan Sumenep
Daf`u al-ilbas `an wahmi al-wiswas
Membaca Kebaikan Bersama Masa Mataram Islam: Sebuah Studi Tentang Diskursus Identitas Ideal Muslim Jawa
Demokrasi Religius : Sebuah Kompilasi Sembilan Artikel Mengenai Demokrasi dalam Islam
Menguak Masa Depan Umat Manusia: Suatu Pendekatan Filsafat Sejarah
Inilah Islam : Pemahaman Dasar Konsep-konsep Islam
Gerakan Islam: Sebuah Analisis
Dekonstruksi syari'ah : wacana kebebasan sipil, hak asasi manusia, dan hubungan internasional dalam Islam